Mołdawia boryka się z nieefektywną strukturą samorządu terytorialnego. Państwo (bez Naddniestrza) dzieli się według radzieckiego modelu na 32 raiony, miasta wydzielone Kiszyniów i Bielce oraz Terytorium Autonomiczne Gagauzji. Do 2024 r. w skład raionów wchodziło 896 gmin, w większości niewydolnych kadrowo i finansowo – 56% z nich miało poniżej 1500 mieszkańców, a 30% ich budżetów pochłaniały koszty własne. Przyjęty przez PAS w 2023 r. program dobrowolnego łączenia się gmin został zdynamizowany w br. (jeszcze w 2025 r. Komisja Europejska oceniała go jako zbyt powolny) dzięki uproszczeniu procedur i zwiększeniu premii inwestycyjnej dla samorządów z ok. 50 do 150 euro na mieszkańca. Do wygaśnięcia programu w sierpniu br. 563 gminy połączyły się i powstały 163 nowe jednostki. Pozostałe 273 gminy, które nie przystąpiły do programu lub nie osiągnęły minimalnej liczby 3 tys. mieszkańców, poddane zostaną łączeniu przymusowemu. Towarzyszyć ma temu nowy podział kompetencji między gminy a mające powstać w miejsce raionów nowe jednostki:
trzy duże regiony oraz (otrzymujące zbliżony status) Gagauzję i miasta wydzielone – poza Kiszyniowem i Bielcami ma nim zostać zamieszkana w większości przez Bułgarów Taraclia. Reforma ma zakończyć się przed zaplanowanymi na jesień
2027 r. wyborami samorządowymi.